Феодосийский музей древностей стал членом Союза музеев России. Как пояснил директор музея Александр Родионов, эта организация объединяет музеи всей страны как общественные институты. Взаимодействует с федеральными и республиканскими органами власти и отстаивает перед ними интересы музеев, участвует в обсуждения всех законодательных и нормативно-правовых актов, так или иначе касающихся деятельности музеев в России.
Союз музеев организует межмузейное взаимодействие, изучает проблемы внедрения в современную музейную практику технологических инноваций, занимается вопросами гармоничного сочетания новых технологий с уже устоявшимися музейными традициями по хранению предметов и их реставрации.
Союз музеев России учрежден в ноябре 2001 года. С 2015 года музеи Крыма планомерно становятся членами данного сообщества. В настоящее время в организации более 400 музеев из 76 субъектов Российской Федерации. Теперь к ним присоединился и Феодосийский музей древностей.